Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
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ZBED1O96006 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
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ZBED1O96006 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
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ZBED1O96006 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
ZBED1O96006 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
ZBED1O96006 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
ZBED1O96006 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZBED1O96006 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZBED1O96006 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZBED1O96006 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZBED1O96006 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZBED1O96006 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZBED1O96006 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZBED1O96006 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZBED1O96006 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZBED1O96006 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZBED1O96006 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZBED1O96006 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZBED1O96006 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZBED1O96006 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZBED1O96006 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZBED1O96006 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZBED1O96006 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZBED1O96006 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZBED1O96006 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZBED1O96006 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
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