Protein–RNA interactions for Protein: O95931

CBX7, Chromobox protein homolog 7, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX7O95931 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBX7O95931 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBX7O95931 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBX7O95931 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBX7O95931 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBX7O95931 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CBX7O95931 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CBX7O95931 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBX7O95931 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBX7O95931 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBX7O95931 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBX7O95931 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBX7O95931 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBX7O95931 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBX7O95931 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CBX7O95931 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBX7O95931 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CBX7O95931 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBX7O95931 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBX7O95931 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBX7O95931 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CBX7O95931 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CBX7O95931 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CBX7O95931 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CBX7O95931 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CBX7O95931 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CBX7O95931 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CBX7O95931 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CBX7O95931 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CBX7O95931 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CBX7O95931 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CBX7O95931 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CBX7O95931 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CBX7O95931 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CBX7O95931 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CBX7O95931 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CBX7O95931 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CBX7O95931 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CBX7O95931 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CBX7O95931 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CBX7O95931 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CBX7O95931 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CBX7O95931 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CBX7O95931 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CBX7O95931 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CBX7O95931 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CBX7O95931 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CBX7O95931 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CBX7O95931 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CBX7O95931 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CBX7O95931 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CBX7O95931 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CBX7O95931 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CBX7O95931 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CBX7O95931 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CBX7O95931 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CBX7O95931 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CBX7O95931 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CBX7O95931 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CBX7O95931 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CBX7O95931 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CBX7O95931 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CBX7O95931 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CBX7O95931 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CBX7O95931 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CBX7O95931 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CBX7O95931 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CBX7O95931 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CBX7O95931 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CBX7O95931 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CBX7O95931 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CBX7O95931 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CBX7O95931 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CBX7O95931 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CBX7O95931 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CBX7O95931 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CBX7O95931 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CBX7O95931 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CBX7O95931 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CBX7O95931 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CBX7O95931 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CBX7O95931 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CBX7O95931 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CBX7O95931 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CBX7O95931 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CBX7O95931 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CBX7O95931 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CBX7O95931 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CBX7O95931 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CBX7O95931 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CBX7O95931 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CBX7O95931 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CBX7O95931 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CBX7O95931 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CBX7O95931 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CBX7O95931 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CBX7O95931 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CBX7O95931 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CBX7O95931 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CBX7O95931 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms