Protein–RNA interactions for Protein: O95236

APOL3, Apolipoprotein L3, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL3O95236 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOL3O95236 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
APOL3O95236 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOL3O95236 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOL3O95236 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOL3O95236 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOL3O95236 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOL3O95236 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
APOL3O95236 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOL3O95236 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOL3O95236 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOL3O95236 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOL3O95236 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOL3O95236 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOL3O95236 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOL3O95236 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOL3O95236 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOL3O95236 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
APOL3O95236 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOL3O95236 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOL3O95236 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOL3O95236 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOL3O95236 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
APOL3O95236 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOL3O95236 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOL3O95236 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOL3O95236 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOL3O95236 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOL3O95236 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOL3O95236 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
APOL3O95236 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOL3O95236 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
APOL3O95236 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.15
APOL3O95236 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
APOL3O95236 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
APOL3O95236 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
APOL3O95236 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
APOL3O95236 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
APOL3O95236 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
APOL3O95236 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
APOL3O95236 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
APOL3O95236 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
APOL3O95236 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
APOL3O95236 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
APOL3O95236 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
APOL3O95236 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
APOL3O95236 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
APOL3O95236 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
APOL3O95236 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
APOL3O95236 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOL3O95236 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOL3O95236 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
APOL3O95236 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOL3O95236 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOL3O95236 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOL3O95236 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOL3O95236 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOL3O95236 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOL3O95236 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOL3O95236 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOL3O95236 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOL3O95236 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOL3O95236 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOL3O95236 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOL3O95236 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOL3O95236 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOL3O95236 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOL3O95236 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOL3O95236 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOL3O95236 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOL3O95236 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOL3O95236 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOL3O95236 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOL3O95236 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOL3O95236 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOL3O95236 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOL3O95236 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
APOL3O95236 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOL3O95236 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOL3O95236 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOL3O95236 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
APOL3O95236 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
APOL3O95236 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOL3O95236 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOL3O95236 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOL3O95236 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOL3O95236 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOL3O95236 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
APOL3O95236 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOL3O95236 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOL3O95236 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOL3O95236 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOL3O95236 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOL3O95236 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOL3O95236 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOL3O95236 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOL3O95236 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOL3O95236 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOL3O95236 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOL3O95236 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms