Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CREB3O43889 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CREB3O43889 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CREB3O43889 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CREB3O43889 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CREB3O43889 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CREB3O43889 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CREB3O43889 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CREB3O43889 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CREB3O43889 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CREB3O43889 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CREB3O43889 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CREB3O43889 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CREB3O43889 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CREB3O43889 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CREB3O43889 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CREB3O43889 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CREB3O43889 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CREB3O43889 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CREB3O43889 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CREB3O43889 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CREB3O43889 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CREB3O43889 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CREB3O43889 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CREB3O43889 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CREB3O43889 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CREB3O43889 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CREB3O43889 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CREB3O43889 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CREB3O43889 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CREB3O43889 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CREB3O43889 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CREB3O43889 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CREB3O43889 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CREB3O43889 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CREB3O43889 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CREB3O43889 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CREB3O43889 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CREB3O43889 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CREB3O43889 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CREB3O43889 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CREB3O43889 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CREB3O43889 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CREB3O43889 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CREB3O43889 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CREB3O43889 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CREB3O43889 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CREB3O43889 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CREB3O43889 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CREB3O43889 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CREB3O43889 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CREB3O43889 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CREB3O43889 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CREB3O43889 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CREB3O43889 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CREB3O43889 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CREB3O43889 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CREB3O43889 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CREB3O43889 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CREB3O43889 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CREB3O43889 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CREB3O43889 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CREB3O43889 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CREB3O43889 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CREB3O43889 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CREB3O43889 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CREB3O43889 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CREB3O43889 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CREB3O43889 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CREB3O43889 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CREB3O43889 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CREB3O43889 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CREB3O43889 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CREB3O43889 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CREB3O43889 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CREB3O43889 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CREB3O43889 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CREB3O43889 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CREB3O43889 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CREB3O43889 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CREB3O43889 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CREB3O43889 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CREB3O43889 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CREB3O43889 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CREB3O43889 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CREB3O43889 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CREB3O43889 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CREB3O43889 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CREB3O43889 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CREB3O43889 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CREB3O43889 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CREB3O43889 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CREB3O43889 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CREB3O43889 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CREB3O43889 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CREB3O43889 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CREB3O43889 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CREB3O43889 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CREB3O43889 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CREB3O43889 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms