Protein–RNA interactions for Protein: O15228

GNPAT, Dihydroxyacetone phosphate acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPATO15228 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GNPATO15228 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GNPATO15228 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GNPATO15228 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GNPATO15228 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GNPATO15228 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GNPATO15228 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GNPATO15228 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GNPATO15228 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GNPATO15228 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GNPATO15228 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GNPATO15228 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GNPATO15228 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GNPATO15228 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GNPATO15228 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GNPATO15228 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GNPATO15228 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GNPATO15228 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GNPATO15228 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GNPATO15228 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GNPATO15228 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GNPATO15228 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GNPATO15228 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GNPATO15228 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GNPATO15228 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GNPATO15228 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GNPATO15228 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GNPATO15228 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GNPATO15228 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GNPATO15228 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GNPATO15228 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GNPATO15228 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GNPATO15228 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GNPATO15228 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GNPATO15228 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GNPATO15228 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GNPATO15228 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GNPATO15228 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GNPATO15228 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GNPATO15228 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GNPATO15228 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GNPATO15228 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GNPATO15228 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GNPATO15228 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GNPATO15228 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GNPATO15228 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GNPATO15228 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GNPATO15228 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GNPATO15228 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GNPATO15228 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GNPATO15228 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GNPATO15228 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GNPATO15228 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GNPATO15228 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GNPATO15228 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GNPATO15228 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GNPATO15228 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GNPATO15228 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GNPATO15228 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GNPATO15228 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GNPATO15228 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GNPATO15228 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GNPATO15228 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GNPATO15228 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GNPATO15228 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GNPATO15228 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GNPATO15228 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GNPATO15228 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GNPATO15228 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GNPATO15228 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GNPATO15228 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GNPATO15228 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GNPATO15228 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GNPATO15228 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GNPATO15228 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GNPATO15228 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GNPATO15228 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GNPATO15228 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GNPATO15228 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GNPATO15228 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GNPATO15228 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GNPATO15228 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GNPATO15228 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GNPATO15228 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GNPATO15228 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GNPATO15228 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GNPATO15228 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GNPATO15228 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GNPATO15228 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GNPATO15228 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GNPATO15228 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GNPATO15228 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GNPATO15228 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GNPATO15228 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GNPATO15228 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GNPATO15228 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GNPATO15228 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GNPATO15228 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GNPATO15228 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GNPATO15228 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms