Protein–RNA interactions for Protein: E9PKD4

NPIPA5, Nuclear pore complex-interacting protein family member A5, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA5E9PKD4 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NPIPA5E9PKD4 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NPIPA5E9PKD4 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NPIPA5E9PKD4 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NPIPA5E9PKD4 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
NPIPA5E9PKD4 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NPIPA5E9PKD4 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NPIPA5E9PKD4 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NPIPA5E9PKD4 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NPIPA5E9PKD4 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NPIPA5E9PKD4 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
NPIPA5E9PKD4 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NPIPA5E9PKD4 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NPIPA5E9PKD4 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NPIPA5E9PKD4 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NPIPA5E9PKD4 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NPIPA5E9PKD4 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NPIPA5E9PKD4 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NPIPA5E9PKD4 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NPIPA5E9PKD4 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NPIPA5E9PKD4 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NPIPA5E9PKD4 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NPIPA5E9PKD4 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NPIPA5E9PKD4 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NPIPA5E9PKD4 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NPIPA5E9PKD4 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NPIPA5E9PKD4 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NPIPA5E9PKD4 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NPIPA5E9PKD4 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NPIPA5E9PKD4 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NPIPA5E9PKD4 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NPIPA5E9PKD4 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NPIPA5E9PKD4 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NPIPA5E9PKD4 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NPIPA5E9PKD4 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NPIPA5E9PKD4 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NPIPA5E9PKD4 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NPIPA5E9PKD4 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NPIPA5E9PKD4 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NPIPA5E9PKD4 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NPIPA5E9PKD4 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NPIPA5E9PKD4 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NPIPA5E9PKD4 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NPIPA5E9PKD4 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NPIPA5E9PKD4 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NPIPA5E9PKD4 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NPIPA5E9PKD4 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms