Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLDN25C9JDP6 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLDN25C9JDP6 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLDN25C9JDP6 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLDN25C9JDP6 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLDN25C9JDP6 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLDN25C9JDP6 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLDN25C9JDP6 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLDN25C9JDP6 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLDN25C9JDP6 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLDN25C9JDP6 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLDN25C9JDP6 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLDN25C9JDP6 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLDN25C9JDP6 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CLDN25C9JDP6 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLDN25C9JDP6 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLDN25C9JDP6 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLDN25C9JDP6 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLDN25C9JDP6 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLDN25C9JDP6 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLDN25C9JDP6 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CLDN25C9JDP6 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLDN25C9JDP6 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLDN25C9JDP6 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLDN25C9JDP6 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLDN25C9JDP6 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLDN25C9JDP6 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLDN25C9JDP6 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLDN25C9JDP6 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLDN25C9JDP6 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CLDN25C9JDP6 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLDN25C9JDP6 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLDN25C9JDP6 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLDN25C9JDP6 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLDN25C9JDP6 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CLDN25C9JDP6 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLDN25C9JDP6 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLDN25C9JDP6 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CLDN25C9JDP6 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLDN25C9JDP6 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CLDN25C9JDP6 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLDN25C9JDP6 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLDN25C9JDP6 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLDN25C9JDP6 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CLDN25C9JDP6 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLDN25C9JDP6 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CLDN25C9JDP6 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLDN25C9JDP6 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLDN25C9JDP6 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CLDN25C9JDP6 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLDN25C9JDP6 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLDN25C9JDP6 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLDN25C9JDP6 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CLDN25C9JDP6 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CLDN25C9JDP6 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CLDN25C9JDP6 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CLDN25C9JDP6 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLDN25C9JDP6 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLDN25C9JDP6 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLDN25C9JDP6 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLDN25C9JDP6 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLDN25C9JDP6 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLDN25C9JDP6 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLDN25C9JDP6 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLDN25C9JDP6 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLDN25C9JDP6 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLDN25C9JDP6 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLDN25C9JDP6 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLDN25C9JDP6 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLDN25C9JDP6 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLDN25C9JDP6 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLDN25C9JDP6 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLDN25C9JDP6 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLDN25C9JDP6 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLDN25C9JDP6 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLDN25C9JDP6 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLDN25C9JDP6 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLDN25C9JDP6 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLDN25C9JDP6 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLDN25C9JDP6 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLDN25C9JDP6 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLDN25C9JDP6 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLDN25C9JDP6 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CLDN25C9JDP6 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLDN25C9JDP6 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLDN25C9JDP6 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLDN25C9JDP6 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLDN25C9JDP6 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLDN25C9JDP6 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLDN25C9JDP6 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLDN25C9JDP6 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLDN25C9JDP6 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLDN25C9JDP6 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLDN25C9JDP6 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLDN25C9JDP6 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN25C9JDP6 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN25C9JDP6 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN25C9JDP6 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN25C9JDP6 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN25C9JDP6 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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