Protein–RNA interactions for Protein: B5MD39

GGTLC3, Putative glutathione hydrolase light chain 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGTLC3B5MD39 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GGTLC3B5MD39 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GGTLC3B5MD39 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GGTLC3B5MD39 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GGTLC3B5MD39 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GGTLC3B5MD39 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GGTLC3B5MD39 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GGTLC3B5MD39 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GGTLC3B5MD39 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GGTLC3B5MD39 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GGTLC3B5MD39 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GGTLC3B5MD39 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GGTLC3B5MD39 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GGTLC3B5MD39 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GGTLC3B5MD39 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
GGTLC3B5MD39 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
GGTLC3B5MD39 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
GGTLC3B5MD39 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
GGTLC3B5MD39 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
GGTLC3B5MD39 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
GGTLC3B5MD39 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
GGTLC3B5MD39 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
GGTLC3B5MD39 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
GGTLC3B5MD39 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
GGTLC3B5MD39 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
GGTLC3B5MD39 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
GGTLC3B5MD39 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
GGTLC3B5MD39 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
GGTLC3B5MD39 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
GGTLC3B5MD39 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
GGTLC3B5MD39 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
GGTLC3B5MD39 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
GGTLC3B5MD39 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
GGTLC3B5MD39 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
GGTLC3B5MD39 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
GGTLC3B5MD39 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
GGTLC3B5MD39 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
GGTLC3B5MD39 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
GGTLC3B5MD39 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
GGTLC3B5MD39 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
GGTLC3B5MD39 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
GGTLC3B5MD39 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
GGTLC3B5MD39 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
GGTLC3B5MD39 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
GGTLC3B5MD39 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
GGTLC3B5MD39 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
GGTLC3B5MD39 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
GGTLC3B5MD39 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
GGTLC3B5MD39 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
GGTLC3B5MD39 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
GGTLC3B5MD39 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
GGTLC3B5MD39 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
GGTLC3B5MD39 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
GGTLC3B5MD39 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
GGTLC3B5MD39 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
GGTLC3B5MD39 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
GGTLC3B5MD39 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
GGTLC3B5MD39 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
GGTLC3B5MD39 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
GGTLC3B5MD39 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
GGTLC3B5MD39 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
GGTLC3B5MD39 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
GGTLC3B5MD39 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
GGTLC3B5MD39 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
GGTLC3B5MD39 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
GGTLC3B5MD39 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
GGTLC3B5MD39 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
GGTLC3B5MD39 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
GGTLC3B5MD39 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
GGTLC3B5MD39 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
GGTLC3B5MD39 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
GGTLC3B5MD39 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
GGTLC3B5MD39 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
GGTLC3B5MD39 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
GGTLC3B5MD39 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
GGTLC3B5MD39 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
GGTLC3B5MD39 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
GGTLC3B5MD39 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
GGTLC3B5MD39 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
GGTLC3B5MD39 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
GGTLC3B5MD39 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
GGTLC3B5MD39 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
GGTLC3B5MD39 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
GGTLC3B5MD39 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC13.61□□□□□ -0.23
GGTLC3B5MD39 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
GGTLC3B5MD39 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
GGTLC3B5MD39 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
GGTLC3B5MD39 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
GGTLC3B5MD39 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
GGTLC3B5MD39 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
GGTLC3B5MD39 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
GGTLC3B5MD39 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
GGTLC3B5MD39 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
GGTLC3B5MD39 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
GGTLC3B5MD39 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
GGTLC3B5MD39 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
GGTLC3B5MD39 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
GGTLC3B5MD39 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
GGTLC3B5MD39 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
GGTLC3B5MD39 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms