Protein–RNA interactions for Protein: A6NDK9

GOLGA6C, Golgin subfamily A member 6C, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6CA6NDK9 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GOLGA6CA6NDK9 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GOLGA6CA6NDK9 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GOLGA6CA6NDK9 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GOLGA6CA6NDK9 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GOLGA6CA6NDK9 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GOLGA6CA6NDK9 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GOLGA6CA6NDK9 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GOLGA6CA6NDK9 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GOLGA6CA6NDK9 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GOLGA6CA6NDK9 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GOLGA6CA6NDK9 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GOLGA6CA6NDK9 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GOLGA6CA6NDK9 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GOLGA6CA6NDK9 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GOLGA6CA6NDK9 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GOLGA6CA6NDK9 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GOLGA6CA6NDK9 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GOLGA6CA6NDK9 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GOLGA6CA6NDK9 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GOLGA6CA6NDK9 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GOLGA6CA6NDK9 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GOLGA6CA6NDK9 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GOLGA6CA6NDK9 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GOLGA6CA6NDK9 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GOLGA6CA6NDK9 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
GOLGA6CA6NDK9 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GOLGA6CA6NDK9 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GOLGA6CA6NDK9 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GOLGA6CA6NDK9 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms