Protein–RNA interactions for Protein: A1A4Y4

IRGM, Immunity-related GTPase family M protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGMA1A4Y4 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRGMA1A4Y4 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms