Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WW87

IGKV2-40, Immunoglobulin kappa variable 2-40, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 121 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV2-40A0A087WW87 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IGKV2-40A0A087WW87 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IGKV2-40A0A087WW87 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IGKV2-40A0A087WW87 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IGKV2-40A0A087WW87 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IGKV2-40A0A087WW87 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IGKV2-40A0A087WW87 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IGKV2-40A0A087WW87 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IGKV2-40A0A087WW87 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IGKV2-40A0A087WW87 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IGKV2-40A0A087WW87 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IGKV2-40A0A087WW87 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IGKV2-40A0A087WW87 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IGKV2-40A0A087WW87 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IGKV2-40A0A087WW87 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IGKV2-40A0A087WW87 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IGKV2-40A0A087WW87 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IGKV2-40A0A087WW87 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IGKV2-40A0A087WW87 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IGKV2-40A0A087WW87 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IGKV2-40A0A087WW87 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IGKV2-40A0A087WW87 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
IGKV2-40A0A087WW87 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IGKV2-40A0A087WW87 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
IGKV2-40A0A087WW87 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IGKV2-40A0A087WW87 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IGKV2-40A0A087WW87 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IGKV2-40A0A087WW87 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IGKV2-40A0A087WW87 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IGKV2-40A0A087WW87 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IGKV2-40A0A087WW87 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IGKV2-40A0A087WW87 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IGKV2-40A0A087WW87 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IGKV2-40A0A087WW87 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IGKV2-40A0A087WW87 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IGKV2-40A0A087WW87 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IGKV2-40A0A087WW87 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IGKV2-40A0A087WW87 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IGKV2-40A0A087WW87 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IGKV2-40A0A087WW87 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IGKV2-40A0A087WW87 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IGKV2-40A0A087WW87 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
IGKV2-40A0A087WW87 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
IGKV2-40A0A087WW87 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
IGKV2-40A0A087WW87 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
IGKV2-40A0A087WW87 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
IGKV2-40A0A087WW87 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
IGKV2-40A0A087WW87 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
IGKV2-40A0A087WW87 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
IGKV2-40A0A087WW87 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
IGKV2-40A0A087WW87 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
IGKV2-40A0A087WW87 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
IGKV2-40A0A087WW87 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
IGKV2-40A0A087WW87 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
IGKV2-40A0A087WW87 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
IGKV2-40A0A087WW87 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
IGKV2-40A0A087WW87 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
IGKV2-40A0A087WW87 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
IGKV2-40A0A087WW87 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
IGKV2-40A0A087WW87 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
IGKV2-40A0A087WW87 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
IGKV2-40A0A087WW87 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
IGKV2-40A0A087WW87 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
IGKV2-40A0A087WW87 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
IGKV2-40A0A087WW87 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
IGKV2-40A0A087WW87 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
IGKV2-40A0A087WW87 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
IGKV2-40A0A087WW87 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
IGKV2-40A0A087WW87 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
IGKV2-40A0A087WW87 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
IGKV2-40A0A087WW87 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
IGKV2-40A0A087WW87 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
IGKV2-40A0A087WW87 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
IGKV2-40A0A087WW87 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
IGKV2-40A0A087WW87 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
IGKV2-40A0A087WW87 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
IGKV2-40A0A087WW87 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
IGKV2-40A0A087WW87 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
IGKV2-40A0A087WW87 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
IGKV2-40A0A087WW87 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
IGKV2-40A0A087WW87 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
IGKV2-40A0A087WW87 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
IGKV2-40A0A087WW87 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
IGKV2-40A0A087WW87 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
IGKV2-40A0A087WW87 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
IGKV2-40A0A087WW87 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
IGKV2-40A0A087WW87 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
IGKV2-40A0A087WW87 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
IGKV2-40A0A087WW87 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
IGKV2-40A0A087WW87 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
IGKV2-40A0A087WW87 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
IGKV2-40A0A087WW87 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
IGKV2-40A0A087WW87 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
IGKV2-40A0A087WW87 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
IGKV2-40A0A087WW87 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
IGKV2-40A0A087WW87 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
IGKV2-40A0A087WW87 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
IGKV2-40A0A087WW87 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
IGKV2-40A0A087WW87 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
IGKV2-40A0A087WW87 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
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