Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R1

SLC4A4, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A4Q9Y6R1 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC4A4Q9Y6R1 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC4A4Q9Y6R1 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC4A4Q9Y6R1 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC4A4Q9Y6R1 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC4A4Q9Y6R1 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC4A4Q9Y6R1 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC4A4Q9Y6R1 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC4A4Q9Y6R1 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC4A4Q9Y6R1 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC4A4Q9Y6R1 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC4A4Q9Y6R1 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC4A4Q9Y6R1 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC4A4Q9Y6R1 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC4A4Q9Y6R1 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC4A4Q9Y6R1 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC4A4Q9Y6R1 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC4A4Q9Y6R1 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC4A4Q9Y6R1 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC4A4Q9Y6R1 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC4A4Q9Y6R1 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC4A4Q9Y6R1 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC4A4Q9Y6R1 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC4A4Q9Y6R1 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC4A4Q9Y6R1 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC4A4Q9Y6R1 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC4A4Q9Y6R1 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC4A4Q9Y6R1 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC4A4Q9Y6R1 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC4A4Q9Y6R1 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC4A4Q9Y6R1 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC4A4Q9Y6R1 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC4A4Q9Y6R1 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC4A4Q9Y6R1 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC4A4Q9Y6R1 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC4A4Q9Y6R1 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC4A4Q9Y6R1 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC4A4Q9Y6R1 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC4A4Q9Y6R1 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC4A4Q9Y6R1 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC4A4Q9Y6R1 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC4A4Q9Y6R1 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC4A4Q9Y6R1 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC4A4Q9Y6R1 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC4A4Q9Y6R1 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC4A4Q9Y6R1 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC4A4Q9Y6R1 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC4A4Q9Y6R1 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC4A4Q9Y6R1 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC4A4Q9Y6R1 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC4A4Q9Y6R1 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC4A4Q9Y6R1 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC4A4Q9Y6R1 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC4A4Q9Y6R1 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC4A4Q9Y6R1 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC4A4Q9Y6R1 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC4A4Q9Y6R1 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC4A4Q9Y6R1 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC4A4Q9Y6R1 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC4A4Q9Y6R1 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC4A4Q9Y6R1 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC4A4Q9Y6R1 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC4A4Q9Y6R1 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC4A4Q9Y6R1 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC4A4Q9Y6R1 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC4A4Q9Y6R1 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC4A4Q9Y6R1 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC4A4Q9Y6R1 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC4A4Q9Y6R1 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC4A4Q9Y6R1 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC4A4Q9Y6R1 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC4A4Q9Y6R1 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC4A4Q9Y6R1 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC4A4Q9Y6R1 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC4A4Q9Y6R1 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC4A4Q9Y6R1 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC4A4Q9Y6R1 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC4A4Q9Y6R1 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC4A4Q9Y6R1 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC4A4Q9Y6R1 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC4A4Q9Y6R1 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC4A4Q9Y6R1 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC4A4Q9Y6R1 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC4A4Q9Y6R1 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC4A4Q9Y6R1 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC4A4Q9Y6R1 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC4A4Q9Y6R1 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC4A4Q9Y6R1 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC4A4Q9Y6R1 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC4A4Q9Y6R1 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC4A4Q9Y6R1 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC4A4Q9Y6R1 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC4A4Q9Y6R1 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC4A4Q9Y6R1 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC4A4Q9Y6R1 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC4A4Q9Y6R1 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC4A4Q9Y6R1 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC4A4Q9Y6R1 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms