Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5R8

TRAPPC1, Trafficking protein particle complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC1Q9Y5R8 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms