Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E1

WASHC2C, WASH complex subunit 2C, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WASHC2CQ9Y4E1 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
WASHC2CQ9Y4E1 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
WASHC2CQ9Y4E1 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
WASHC2CQ9Y4E1 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
WASHC2CQ9Y4E1 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
WASHC2CQ9Y4E1 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
WASHC2CQ9Y4E1 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
WASHC2CQ9Y4E1 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
WASHC2CQ9Y4E1 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
WASHC2CQ9Y4E1 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
WASHC2CQ9Y4E1 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
WASHC2CQ9Y4E1 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
WASHC2CQ9Y4E1 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
WASHC2CQ9Y4E1 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
WASHC2CQ9Y4E1 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
WASHC2CQ9Y4E1 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
WASHC2CQ9Y4E1 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
WASHC2CQ9Y4E1 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
WASHC2CQ9Y4E1 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
WASHC2CQ9Y4E1 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
WASHC2CQ9Y4E1 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
WASHC2CQ9Y4E1 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
WASHC2CQ9Y4E1 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
WASHC2CQ9Y4E1 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
WASHC2CQ9Y4E1 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
WASHC2CQ9Y4E1 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
WASHC2CQ9Y4E1 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
WASHC2CQ9Y4E1 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
WASHC2CQ9Y4E1 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
WASHC2CQ9Y4E1 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
WASHC2CQ9Y4E1 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
WASHC2CQ9Y4E1 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
WASHC2CQ9Y4E1 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
WASHC2CQ9Y4E1 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
WASHC2CQ9Y4E1 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
WASHC2CQ9Y4E1 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
WASHC2CQ9Y4E1 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
WASHC2CQ9Y4E1 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
WASHC2CQ9Y4E1 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
WASHC2CQ9Y4E1 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
WASHC2CQ9Y4E1 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
WASHC2CQ9Y4E1 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
WASHC2CQ9Y4E1 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
WASHC2CQ9Y4E1 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
WASHC2CQ9Y4E1 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
WASHC2CQ9Y4E1 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
WASHC2CQ9Y4E1 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
WASHC2CQ9Y4E1 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
WASHC2CQ9Y4E1 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
WASHC2CQ9Y4E1 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
WASHC2CQ9Y4E1 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
WASHC2CQ9Y4E1 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
WASHC2CQ9Y4E1 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
WASHC2CQ9Y4E1 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
WASHC2CQ9Y4E1 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
WASHC2CQ9Y4E1 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
WASHC2CQ9Y4E1 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
WASHC2CQ9Y4E1 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
WASHC2CQ9Y4E1 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
WASHC2CQ9Y4E1 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
WASHC2CQ9Y4E1 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
WASHC2CQ9Y4E1 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
WASHC2CQ9Y4E1 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
WASHC2CQ9Y4E1 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
WASHC2CQ9Y4E1 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
WASHC2CQ9Y4E1 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
WASHC2CQ9Y4E1 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
WASHC2CQ9Y4E1 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
WASHC2CQ9Y4E1 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
WASHC2CQ9Y4E1 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
WASHC2CQ9Y4E1 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
WASHC2CQ9Y4E1 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
WASHC2CQ9Y4E1 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
WASHC2CQ9Y4E1 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
WASHC2CQ9Y4E1 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
WASHC2CQ9Y4E1 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
WASHC2CQ9Y4E1 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
WASHC2CQ9Y4E1 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
WASHC2CQ9Y4E1 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
WASHC2CQ9Y4E1 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
WASHC2CQ9Y4E1 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
WASHC2CQ9Y4E1 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
WASHC2CQ9Y4E1 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
WASHC2CQ9Y4E1 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
WASHC2CQ9Y4E1 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
WASHC2CQ9Y4E1 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
WASHC2CQ9Y4E1 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
WASHC2CQ9Y4E1 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
WASHC2CQ9Y4E1 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
WASHC2CQ9Y4E1 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
WASHC2CQ9Y4E1 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
WASHC2CQ9Y4E1 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
WASHC2CQ9Y4E1 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
WASHC2CQ9Y4E1 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
WASHC2CQ9Y4E1 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
WASHC2CQ9Y4E1 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
WASHC2CQ9Y4E1 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
WASHC2CQ9Y4E1 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
WASHC2CQ9Y4E1 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
WASHC2CQ9Y4E1 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms