Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C0

NRXN3, Neurexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN3Q9Y4C0 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NRXN3Q9Y4C0 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NRXN3Q9Y4C0 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NRXN3Q9Y4C0 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NRXN3Q9Y4C0 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NRXN3Q9Y4C0 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NRXN3Q9Y4C0 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NRXN3Q9Y4C0 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NRXN3Q9Y4C0 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NRXN3Q9Y4C0 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NRXN3Q9Y4C0 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NRXN3Q9Y4C0 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NRXN3Q9Y4C0 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NRXN3Q9Y4C0 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NRXN3Q9Y4C0 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NRXN3Q9Y4C0 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NRXN3Q9Y4C0 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NRXN3Q9Y4C0 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NRXN3Q9Y4C0 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NRXN3Q9Y4C0 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NRXN3Q9Y4C0 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NRXN3Q9Y4C0 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NRXN3Q9Y4C0 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NRXN3Q9Y4C0 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NRXN3Q9Y4C0 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NRXN3Q9Y4C0 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NRXN3Q9Y4C0 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NRXN3Q9Y4C0 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NRXN3Q9Y4C0 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NRXN3Q9Y4C0 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NRXN3Q9Y4C0 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NRXN3Q9Y4C0 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NRXN3Q9Y4C0 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
NRXN3Q9Y4C0 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NRXN3Q9Y4C0 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NRXN3Q9Y4C0 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NRXN3Q9Y4C0 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NRXN3Q9Y4C0 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NRXN3Q9Y4C0 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NRXN3Q9Y4C0 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NRXN3Q9Y4C0 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NRXN3Q9Y4C0 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NRXN3Q9Y4C0 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NRXN3Q9Y4C0 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NRXN3Q9Y4C0 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NRXN3Q9Y4C0 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NRXN3Q9Y4C0 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NRXN3Q9Y4C0 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NRXN3Q9Y4C0 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
NRXN3Q9Y4C0 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NRXN3Q9Y4C0 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
NRXN3Q9Y4C0 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NRXN3Q9Y4C0 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
NRXN3Q9Y4C0 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NRXN3Q9Y4C0 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NRXN3Q9Y4C0 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NRXN3Q9Y4C0 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NRXN3Q9Y4C0 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NRXN3Q9Y4C0 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NRXN3Q9Y4C0 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NRXN3Q9Y4C0 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NRXN3Q9Y4C0 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NRXN3Q9Y4C0 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NRXN3Q9Y4C0 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NRXN3Q9Y4C0 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NRXN3Q9Y4C0 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NRXN3Q9Y4C0 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NRXN3Q9Y4C0 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NRXN3Q9Y4C0 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NRXN3Q9Y4C0 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NRXN3Q9Y4C0 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NRXN3Q9Y4C0 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NRXN3Q9Y4C0 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NRXN3Q9Y4C0 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NRXN3Q9Y4C0 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NRXN3Q9Y4C0 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NRXN3Q9Y4C0 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NRXN3Q9Y4C0 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NRXN3Q9Y4C0 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NRXN3Q9Y4C0 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NRXN3Q9Y4C0 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NRXN3Q9Y4C0 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NRXN3Q9Y4C0 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NRXN3Q9Y4C0 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NRXN3Q9Y4C0 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NRXN3Q9Y4C0 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NRXN3Q9Y4C0 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NRXN3Q9Y4C0 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NRXN3Q9Y4C0 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NRXN3Q9Y4C0 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NRXN3Q9Y4C0 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NRXN3Q9Y4C0 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NRXN3Q9Y4C0 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NRXN3Q9Y4C0 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NRXN3Q9Y4C0 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NRXN3Q9Y4C0 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NRXN3Q9Y4C0 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NRXN3Q9Y4C0 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NRXN3Q9Y4C0 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NRXN3Q9Y4C0 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms