Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3S2

ZNF330, Zinc finger protein 330, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF330Q9Y3S2 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF330Q9Y3S2 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF330Q9Y3S2 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF330Q9Y3S2 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF330Q9Y3S2 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms