Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3P4

RHBDD3, Rhomboid domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD3Q9Y3P4 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms