Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y235

APOBEC2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC2Q9Y235 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms