Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HPS5Q9UPZ3 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms