Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULS5

TMCC3, Transmembrane and coiled-coil domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCC3Q9ULS5 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMCC3Q9ULS5 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMCC3Q9ULS5 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMCC3Q9ULS5 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMCC3Q9ULS5 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMCC3Q9ULS5 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMCC3Q9ULS5 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMCC3Q9ULS5 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TMCC3Q9ULS5 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMCC3Q9ULS5 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMCC3Q9ULS5 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMCC3Q9ULS5 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMCC3Q9ULS5 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMCC3Q9ULS5 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMCC3Q9ULS5 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TMCC3Q9ULS5 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMCC3Q9ULS5 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMCC3Q9ULS5 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMCC3Q9ULS5 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMCC3Q9ULS5 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMCC3Q9ULS5 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMCC3Q9ULS5 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMCC3Q9ULS5 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TMCC3Q9ULS5 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMCC3Q9ULS5 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMCC3Q9ULS5 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMCC3Q9ULS5 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMCC3Q9ULS5 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMCC3Q9ULS5 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMCC3Q9ULS5 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMCC3Q9ULS5 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMCC3Q9ULS5 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMCC3Q9ULS5 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMCC3Q9ULS5 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMCC3Q9ULS5 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMCC3Q9ULS5 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMCC3Q9ULS5 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMCC3Q9ULS5 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMCC3Q9ULS5 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMCC3Q9ULS5 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMCC3Q9ULS5 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMCC3Q9ULS5 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMCC3Q9ULS5 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMCC3Q9ULS5 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TMCC3Q9ULS5 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMCC3Q9ULS5 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMCC3Q9ULS5 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMCC3Q9ULS5 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMCC3Q9ULS5 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMCC3Q9ULS5 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMCC3Q9ULS5 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMCC3Q9ULS5 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMCC3Q9ULS5 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMCC3Q9ULS5 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMCC3Q9ULS5 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMCC3Q9ULS5 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMCC3Q9ULS5 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMCC3Q9ULS5 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMCC3Q9ULS5 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMCC3Q9ULS5 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMCC3Q9ULS5 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMCC3Q9ULS5 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMCC3Q9ULS5 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMCC3Q9ULS5 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMCC3Q9ULS5 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMCC3Q9ULS5 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMCC3Q9ULS5 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMCC3Q9ULS5 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMCC3Q9ULS5 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMCC3Q9ULS5 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMCC3Q9ULS5 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMCC3Q9ULS5 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMCC3Q9ULS5 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMCC3Q9ULS5 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMCC3Q9ULS5 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMCC3Q9ULS5 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMCC3Q9ULS5 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMCC3Q9ULS5 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMCC3Q9ULS5 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMCC3Q9ULS5 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMCC3Q9ULS5 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMCC3Q9ULS5 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMCC3Q9ULS5 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMCC3Q9ULS5 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMCC3Q9ULS5 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMCC3Q9ULS5 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMCC3Q9ULS5 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMCC3Q9ULS5 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMCC3Q9ULS5 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMCC3Q9ULS5 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMCC3Q9ULS5 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMCC3Q9ULS5 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMCC3Q9ULS5 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMCC3Q9ULS5 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMCC3Q9ULS5 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMCC3Q9ULS5 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMCC3Q9ULS5 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMCC3Q9ULS5 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMCC3Q9ULS5 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TMCC3Q9ULS5 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms