Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULG1

INO80, DNA helicase INO80, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80Q9ULG1 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
INO80Q9ULG1 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
INO80Q9ULG1 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
INO80Q9ULG1 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
INO80Q9ULG1 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
INO80Q9ULG1 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
INO80Q9ULG1 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC26■■□□□ 1.75
INO80Q9ULG1 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
INO80Q9ULG1 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
INO80Q9ULG1 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
INO80Q9ULG1 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
INO80Q9ULG1 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
INO80Q9ULG1 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
INO80Q9ULG1 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
INO80Q9ULG1 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
INO80Q9ULG1 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
INO80Q9ULG1 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
INO80Q9ULG1 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
INO80Q9ULG1 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
INO80Q9ULG1 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
INO80Q9ULG1 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
INO80Q9ULG1 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
INO80Q9ULG1 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
INO80Q9ULG1 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
INO80Q9ULG1 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
INO80Q9ULG1 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
INO80Q9ULG1 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
INO80Q9ULG1 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
INO80Q9ULG1 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
INO80Q9ULG1 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
INO80Q9ULG1 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
INO80Q9ULG1 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
INO80Q9ULG1 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
INO80Q9ULG1 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
INO80Q9ULG1 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
INO80Q9ULG1 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
INO80Q9ULG1 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
INO80Q9ULG1 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
INO80Q9ULG1 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
INO80Q9ULG1 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
INO80Q9ULG1 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
INO80Q9ULG1 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
INO80Q9ULG1 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
INO80Q9ULG1 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
INO80Q9ULG1 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
INO80Q9ULG1 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
INO80Q9ULG1 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
INO80Q9ULG1 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
INO80Q9ULG1 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
INO80Q9ULG1 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
INO80Q9ULG1 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
INO80Q9ULG1 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
INO80Q9ULG1 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
INO80Q9ULG1 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
INO80Q9ULG1 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
INO80Q9ULG1 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
INO80Q9ULG1 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
INO80Q9ULG1 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
INO80Q9ULG1 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
INO80Q9ULG1 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
INO80Q9ULG1 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
INO80Q9ULG1 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
INO80Q9ULG1 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
INO80Q9ULG1 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
INO80Q9ULG1 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
INO80Q9ULG1 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
INO80Q9ULG1 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
INO80Q9ULG1 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
INO80Q9ULG1 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
INO80Q9ULG1 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
INO80Q9ULG1 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
INO80Q9ULG1 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
INO80Q9ULG1 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
INO80Q9ULG1 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
INO80Q9ULG1 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
INO80Q9ULG1 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
INO80Q9ULG1 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
INO80Q9ULG1 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
INO80Q9ULG1 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
INO80Q9ULG1 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
INO80Q9ULG1 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
INO80Q9ULG1 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
INO80Q9ULG1 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
INO80Q9ULG1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
INO80Q9ULG1 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
INO80Q9ULG1 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
INO80Q9ULG1 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
INO80Q9ULG1 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
INO80Q9ULG1 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
INO80Q9ULG1 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
INO80Q9ULG1 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
INO80Q9ULG1 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
INO80Q9ULG1 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
INO80Q9ULG1 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
INO80Q9ULG1 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
INO80Q9ULG1 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
INO80Q9ULG1 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
INO80Q9ULG1 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
INO80Q9ULG1 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
INO80Q9ULG1 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms