Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms