Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEE9

CFDP1, Craniofacial development protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1Q9UEE9 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CFDP1Q9UEE9 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CFDP1Q9UEE9 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CFDP1Q9UEE9 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CFDP1Q9UEE9 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CFDP1Q9UEE9 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CFDP1Q9UEE9 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CFDP1Q9UEE9 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CFDP1Q9UEE9 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CFDP1Q9UEE9 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CFDP1Q9UEE9 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CFDP1Q9UEE9 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CFDP1Q9UEE9 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CFDP1Q9UEE9 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CFDP1Q9UEE9 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CFDP1Q9UEE9 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CFDP1Q9UEE9 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CFDP1Q9UEE9 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CFDP1Q9UEE9 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CFDP1Q9UEE9 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CFDP1Q9UEE9 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CFDP1Q9UEE9 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CFDP1Q9UEE9 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CFDP1Q9UEE9 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CFDP1Q9UEE9 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CFDP1Q9UEE9 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CFDP1Q9UEE9 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CFDP1Q9UEE9 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CFDP1Q9UEE9 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CFDP1Q9UEE9 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CFDP1Q9UEE9 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CFDP1Q9UEE9 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CFDP1Q9UEE9 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CFDP1Q9UEE9 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CFDP1Q9UEE9 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CFDP1Q9UEE9 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CFDP1Q9UEE9 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CFDP1Q9UEE9 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CFDP1Q9UEE9 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CFDP1Q9UEE9 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CFDP1Q9UEE9 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CFDP1Q9UEE9 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CFDP1Q9UEE9 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CFDP1Q9UEE9 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CFDP1Q9UEE9 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CFDP1Q9UEE9 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CFDP1Q9UEE9 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CFDP1Q9UEE9 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CFDP1Q9UEE9 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CFDP1Q9UEE9 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CFDP1Q9UEE9 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CFDP1Q9UEE9 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CFDP1Q9UEE9 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CFDP1Q9UEE9 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CFDP1Q9UEE9 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CFDP1Q9UEE9 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CFDP1Q9UEE9 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CFDP1Q9UEE9 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CFDP1Q9UEE9 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CFDP1Q9UEE9 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CFDP1Q9UEE9 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CFDP1Q9UEE9 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CFDP1Q9UEE9 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CFDP1Q9UEE9 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CFDP1Q9UEE9 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CFDP1Q9UEE9 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CFDP1Q9UEE9 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CFDP1Q9UEE9 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CFDP1Q9UEE9 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CFDP1Q9UEE9 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CFDP1Q9UEE9 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CFDP1Q9UEE9 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CFDP1Q9UEE9 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CFDP1Q9UEE9 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CFDP1Q9UEE9 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CFDP1Q9UEE9 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CFDP1Q9UEE9 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CFDP1Q9UEE9 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CFDP1Q9UEE9 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CFDP1Q9UEE9 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CFDP1Q9UEE9 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CFDP1Q9UEE9 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CFDP1Q9UEE9 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CFDP1Q9UEE9 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CFDP1Q9UEE9 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CFDP1Q9UEE9 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CFDP1Q9UEE9 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CFDP1Q9UEE9 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CFDP1Q9UEE9 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CFDP1Q9UEE9 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CFDP1Q9UEE9 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CFDP1Q9UEE9 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CFDP1Q9UEE9 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CFDP1Q9UEE9 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CFDP1Q9UEE9 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CFDP1Q9UEE9 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
CFDP1Q9UEE9 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CFDP1Q9UEE9 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CFDP1Q9UEE9 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CFDP1Q9UEE9 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms