Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms