Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBR1

UPB1, Beta-ureidopropionase, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPB1Q9UBR1 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms