Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZR4

VSX1, Visual system homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSX1Q9NZR4 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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VSX1Q9NZR4 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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VSX1Q9NZR4 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VSX1Q9NZR4 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VSX1Q9NZR4 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VSX1Q9NZR4 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VSX1Q9NZR4 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VSX1Q9NZR4 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VSX1Q9NZR4 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
VSX1Q9NZR4 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VSX1Q9NZR4 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VSX1Q9NZR4 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VSX1Q9NZR4 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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