Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms