Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH8

TOR4A, Torsin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOR4AQ9NXH8 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TOR4AQ9NXH8 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TOR4AQ9NXH8 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TOR4AQ9NXH8 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TOR4AQ9NXH8 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TOR4AQ9NXH8 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TOR4AQ9NXH8 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TOR4AQ9NXH8 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TOR4AQ9NXH8 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TOR4AQ9NXH8 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TOR4AQ9NXH8 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TOR4AQ9NXH8 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TOR4AQ9NXH8 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TOR4AQ9NXH8 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TOR4AQ9NXH8 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TOR4AQ9NXH8 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TOR4AQ9NXH8 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TOR4AQ9NXH8 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TOR4AQ9NXH8 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TOR4AQ9NXH8 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TOR4AQ9NXH8 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TOR4AQ9NXH8 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TOR4AQ9NXH8 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TOR4AQ9NXH8 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TOR4AQ9NXH8 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TOR4AQ9NXH8 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TOR4AQ9NXH8 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TOR4AQ9NXH8 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TOR4AQ9NXH8 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TOR4AQ9NXH8 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TOR4AQ9NXH8 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TOR4AQ9NXH8 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TOR4AQ9NXH8 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TOR4AQ9NXH8 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TOR4AQ9NXH8 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TOR4AQ9NXH8 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TOR4AQ9NXH8 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TOR4AQ9NXH8 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TOR4AQ9NXH8 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TOR4AQ9NXH8 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TOR4AQ9NXH8 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TOR4AQ9NXH8 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TOR4AQ9NXH8 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TOR4AQ9NXH8 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TOR4AQ9NXH8 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TOR4AQ9NXH8 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TOR4AQ9NXH8 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TOR4AQ9NXH8 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TOR4AQ9NXH8 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TOR4AQ9NXH8 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TOR4AQ9NXH8 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TOR4AQ9NXH8 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TOR4AQ9NXH8 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TOR4AQ9NXH8 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TOR4AQ9NXH8 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TOR4AQ9NXH8 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TOR4AQ9NXH8 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TOR4AQ9NXH8 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TOR4AQ9NXH8 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TOR4AQ9NXH8 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TOR4AQ9NXH8 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TOR4AQ9NXH8 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TOR4AQ9NXH8 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TOR4AQ9NXH8 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TOR4AQ9NXH8 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TOR4AQ9NXH8 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TOR4AQ9NXH8 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TOR4AQ9NXH8 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TOR4AQ9NXH8 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TOR4AQ9NXH8 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TOR4AQ9NXH8 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TOR4AQ9NXH8 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TOR4AQ9NXH8 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TOR4AQ9NXH8 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TOR4AQ9NXH8 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TOR4AQ9NXH8 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TOR4AQ9NXH8 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
TOR4AQ9NXH8 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
TOR4AQ9NXH8 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
TOR4AQ9NXH8 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.38
TOR4AQ9NXH8 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TOR4AQ9NXH8 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TOR4AQ9NXH8 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TOR4AQ9NXH8 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TOR4AQ9NXH8 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TOR4AQ9NXH8 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TOR4AQ9NXH8 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TOR4AQ9NXH8 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TOR4AQ9NXH8 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TOR4AQ9NXH8 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TOR4AQ9NXH8 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TOR4AQ9NXH8 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TOR4AQ9NXH8 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TOR4AQ9NXH8 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TOR4AQ9NXH8 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TOR4AQ9NXH8 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TOR4AQ9NXH8 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TOR4AQ9NXH8 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TOR4AQ9NXH8 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TOR4AQ9NXH8 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms