Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXG2

THUMPD1, THUMP domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD1Q9NXG2 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
THUMPD1Q9NXG2 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
THUMPD1Q9NXG2 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
THUMPD1Q9NXG2 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
THUMPD1Q9NXG2 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
THUMPD1Q9NXG2 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
THUMPD1Q9NXG2 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
THUMPD1Q9NXG2 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
THUMPD1Q9NXG2 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
THUMPD1Q9NXG2 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
THUMPD1Q9NXG2 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
THUMPD1Q9NXG2 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
THUMPD1Q9NXG2 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
THUMPD1Q9NXG2 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
THUMPD1Q9NXG2 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
THUMPD1Q9NXG2 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
THUMPD1Q9NXG2 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
THUMPD1Q9NXG2 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
THUMPD1Q9NXG2 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
THUMPD1Q9NXG2 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
THUMPD1Q9NXG2 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
THUMPD1Q9NXG2 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
THUMPD1Q9NXG2 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
THUMPD1Q9NXG2 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
THUMPD1Q9NXG2 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
THUMPD1Q9NXG2 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
THUMPD1Q9NXG2 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
THUMPD1Q9NXG2 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
THUMPD1Q9NXG2 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
THUMPD1Q9NXG2 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
THUMPD1Q9NXG2 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
THUMPD1Q9NXG2 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
THUMPD1Q9NXG2 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
THUMPD1Q9NXG2 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
THUMPD1Q9NXG2 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
THUMPD1Q9NXG2 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
THUMPD1Q9NXG2 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
THUMPD1Q9NXG2 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
THUMPD1Q9NXG2 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
THUMPD1Q9NXG2 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
THUMPD1Q9NXG2 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
THUMPD1Q9NXG2 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
THUMPD1Q9NXG2 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
THUMPD1Q9NXG2 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
THUMPD1Q9NXG2 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
THUMPD1Q9NXG2 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
THUMPD1Q9NXG2 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
THUMPD1Q9NXG2 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
THUMPD1Q9NXG2 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
THUMPD1Q9NXG2 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
THUMPD1Q9NXG2 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
THUMPD1Q9NXG2 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
THUMPD1Q9NXG2 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
THUMPD1Q9NXG2 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
THUMPD1Q9NXG2 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
THUMPD1Q9NXG2 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
THUMPD1Q9NXG2 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
THUMPD1Q9NXG2 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
THUMPD1Q9NXG2 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
THUMPD1Q9NXG2 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
THUMPD1Q9NXG2 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
THUMPD1Q9NXG2 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
THUMPD1Q9NXG2 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
THUMPD1Q9NXG2 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
THUMPD1Q9NXG2 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
THUMPD1Q9NXG2 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
THUMPD1Q9NXG2 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
THUMPD1Q9NXG2 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
THUMPD1Q9NXG2 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
THUMPD1Q9NXG2 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
THUMPD1Q9NXG2 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
THUMPD1Q9NXG2 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
THUMPD1Q9NXG2 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
THUMPD1Q9NXG2 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
THUMPD1Q9NXG2 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
THUMPD1Q9NXG2 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
THUMPD1Q9NXG2 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
THUMPD1Q9NXG2 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
THUMPD1Q9NXG2 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
THUMPD1Q9NXG2 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
THUMPD1Q9NXG2 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
THUMPD1Q9NXG2 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
THUMPD1Q9NXG2 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
THUMPD1Q9NXG2 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
THUMPD1Q9NXG2 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
THUMPD1Q9NXG2 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
THUMPD1Q9NXG2 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
THUMPD1Q9NXG2 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
THUMPD1Q9NXG2 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
THUMPD1Q9NXG2 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
THUMPD1Q9NXG2 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
THUMPD1Q9NXG2 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
THUMPD1Q9NXG2 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
THUMPD1Q9NXG2 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
THUMPD1Q9NXG2 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
THUMPD1Q9NXG2 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
THUMPD1Q9NXG2 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
THUMPD1Q9NXG2 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
THUMPD1Q9NXG2 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
THUMPD1Q9NXG2 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms