Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LMBRD1Q9NUN5 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
LMBRD1Q9NUN5 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
LMBRD1Q9NUN5 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
LMBRD1Q9NUN5 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LMBRD1Q9NUN5 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
LMBRD1Q9NUN5 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
LMBRD1Q9NUN5 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LMBRD1Q9NUN5 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LMBRD1Q9NUN5 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LMBRD1Q9NUN5 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LMBRD1Q9NUN5 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LMBRD1Q9NUN5 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LMBRD1Q9NUN5 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LMBRD1Q9NUN5 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LMBRD1Q9NUN5 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LMBRD1Q9NUN5 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LMBRD1Q9NUN5 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LMBRD1Q9NUN5 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LMBRD1Q9NUN5 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LMBRD1Q9NUN5 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LMBRD1Q9NUN5 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LMBRD1Q9NUN5 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LMBRD1Q9NUN5 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
LMBRD1Q9NUN5 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LMBRD1Q9NUN5 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LMBRD1Q9NUN5 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LMBRD1Q9NUN5 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LMBRD1Q9NUN5 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LMBRD1Q9NUN5 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LMBRD1Q9NUN5 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LMBRD1Q9NUN5 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LMBRD1Q9NUN5 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LMBRD1Q9NUN5 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
LMBRD1Q9NUN5 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LMBRD1Q9NUN5 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LMBRD1Q9NUN5 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
LMBRD1Q9NUN5 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LMBRD1Q9NUN5 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LMBRD1Q9NUN5 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LMBRD1Q9NUN5 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LMBRD1Q9NUN5 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LMBRD1Q9NUN5 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LMBRD1Q9NUN5 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms