Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU39

FOXD4L1, Forkhead box protein D4-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L1Q9NU39 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXD4L1Q9NU39 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXD4L1Q9NU39 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXD4L1Q9NU39 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXD4L1Q9NU39 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXD4L1Q9NU39 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXD4L1Q9NU39 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXD4L1Q9NU39 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXD4L1Q9NU39 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXD4L1Q9NU39 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXD4L1Q9NU39 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXD4L1Q9NU39 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXD4L1Q9NU39 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXD4L1Q9NU39 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXD4L1Q9NU39 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXD4L1Q9NU39 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXD4L1Q9NU39 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXD4L1Q9NU39 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXD4L1Q9NU39 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXD4L1Q9NU39 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXD4L1Q9NU39 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXD4L1Q9NU39 AL117351.1-201ENST00000438864 766 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXD4L1Q9NU39 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXD4L1Q9NU39 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXD4L1Q9NU39 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXD4L1Q9NU39 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXD4L1Q9NU39 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXD4L1Q9NU39 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXD4L1Q9NU39 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXD4L1Q9NU39 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXD4L1Q9NU39 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXD4L1Q9NU39 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXD4L1Q9NU39 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXD4L1Q9NU39 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXD4L1Q9NU39 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXD4L1Q9NU39 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXD4L1Q9NU39 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXD4L1Q9NU39 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXD4L1Q9NU39 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXD4L1Q9NU39 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXD4L1Q9NU39 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXD4L1Q9NU39 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXD4L1Q9NU39 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXD4L1Q9NU39 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXD4L1Q9NU39 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXD4L1Q9NU39 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXD4L1Q9NU39 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXD4L1Q9NU39 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXD4L1Q9NU39 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXD4L1Q9NU39 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXD4L1Q9NU39 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXD4L1Q9NU39 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXD4L1Q9NU39 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXD4L1Q9NU39 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXD4L1Q9NU39 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXD4L1Q9NU39 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXD4L1Q9NU39 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXD4L1Q9NU39 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXD4L1Q9NU39 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXD4L1Q9NU39 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXD4L1Q9NU39 PDZD11-201ENST00000239666 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXD4L1Q9NU39 TIMM10-201ENST00000257245 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXD4L1Q9NU39 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXD4L1Q9NU39 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXD4L1Q9NU39 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXD4L1Q9NU39 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXD4L1Q9NU39 TPRG1-AS2-201ENST00000425454 479 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXD4L1Q9NU39 AC009495.2-201ENST00000457108 506 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXD4L1Q9NU39 KDELR2-206ENST00000490996 655 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXD4L1Q9NU39 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXD4L1Q9NU39 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXD4L1Q9NU39 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXD4L1Q9NU39 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXD4L1Q9NU39 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXD4L1Q9NU39 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXD4L1Q9NU39 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXD4L1Q9NU39 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXD4L1Q9NU39 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXD4L1Q9NU39 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXD4L1Q9NU39 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXD4L1Q9NU39 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXD4L1Q9NU39 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXD4L1Q9NU39 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXD4L1Q9NU39 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXD4L1Q9NU39 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXD4L1Q9NU39 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXD4L1Q9NU39 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXD4L1Q9NU39 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXD4L1Q9NU39 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXD4L1Q9NU39 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXD4L1Q9NU39 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXD4L1Q9NU39 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXD4L1Q9NU39 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXD4L1Q9NU39 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXD4L1Q9NU39 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXD4L1Q9NU39 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXD4L1Q9NU39 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXD4L1Q9NU39 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXD4L1Q9NU39 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXD4L1Q9NU39 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms