Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW7

VPS45, Vacuolar protein sorting-associated protein 45, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS45Q9NRW7 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms