Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQR4

NIT2, Omega-amidase NIT2, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIT2Q9NQR4 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NIT2Q9NQR4 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NIT2Q9NQR4 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NIT2Q9NQR4 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NIT2Q9NQR4 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NIT2Q9NQR4 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NIT2Q9NQR4 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NIT2Q9NQR4 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NIT2Q9NQR4 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NIT2Q9NQR4 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NIT2Q9NQR4 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NIT2Q9NQR4 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NIT2Q9NQR4 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
NIT2Q9NQR4 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NIT2Q9NQR4 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NIT2Q9NQR4 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NIT2Q9NQR4 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
NIT2Q9NQR4 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NIT2Q9NQR4 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NIT2Q9NQR4 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NIT2Q9NQR4 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NIT2Q9NQR4 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NIT2Q9NQR4 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NIT2Q9NQR4 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
NIT2Q9NQR4 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NIT2Q9NQR4 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NIT2Q9NQR4 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NIT2Q9NQR4 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NIT2Q9NQR4 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NIT2Q9NQR4 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NIT2Q9NQR4 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NIT2Q9NQR4 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NIT2Q9NQR4 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NIT2Q9NQR4 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NIT2Q9NQR4 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NIT2Q9NQR4 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NIT2Q9NQR4 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NIT2Q9NQR4 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
NIT2Q9NQR4 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NIT2Q9NQR4 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NIT2Q9NQR4 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NIT2Q9NQR4 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NIT2Q9NQR4 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NIT2Q9NQR4 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NIT2Q9NQR4 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NIT2Q9NQR4 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NIT2Q9NQR4 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NIT2Q9NQR4 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NIT2Q9NQR4 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NIT2Q9NQR4 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NIT2Q9NQR4 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NIT2Q9NQR4 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NIT2Q9NQR4 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
NIT2Q9NQR4 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NIT2Q9NQR4 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
NIT2Q9NQR4 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NIT2Q9NQR4 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NIT2Q9NQR4 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NIT2Q9NQR4 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NIT2Q9NQR4 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NIT2Q9NQR4 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NIT2Q9NQR4 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NIT2Q9NQR4 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NIT2Q9NQR4 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
NIT2Q9NQR4 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
NIT2Q9NQR4 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NIT2Q9NQR4 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NIT2Q9NQR4 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NIT2Q9NQR4 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NIT2Q9NQR4 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NIT2Q9NQR4 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NIT2Q9NQR4 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NIT2Q9NQR4 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NIT2Q9NQR4 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NIT2Q9NQR4 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NIT2Q9NQR4 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NIT2Q9NQR4 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NIT2Q9NQR4 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NIT2Q9NQR4 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
NIT2Q9NQR4 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
NIT2Q9NQR4 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NIT2Q9NQR4 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NIT2Q9NQR4 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NIT2Q9NQR4 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NIT2Q9NQR4 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NIT2Q9NQR4 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NIT2Q9NQR4 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
NIT2Q9NQR4 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NIT2Q9NQR4 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NIT2Q9NQR4 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
NIT2Q9NQR4 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NIT2Q9NQR4 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NIT2Q9NQR4 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NIT2Q9NQR4 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NIT2Q9NQR4 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NIT2Q9NQR4 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NIT2Q9NQR4 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NIT2Q9NQR4 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NIT2Q9NQR4 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NIT2Q9NQR4 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms