Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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