Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD15

SRA1, Steroid receptor RNA activator 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRA1Q9HD15 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRA1Q9HD15 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRA1Q9HD15 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRA1Q9HD15 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRA1Q9HD15 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRA1Q9HD15 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRA1Q9HD15 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRA1Q9HD15 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRA1Q9HD15 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRA1Q9HD15 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRA1Q9HD15 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRA1Q9HD15 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRA1Q9HD15 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRA1Q9HD15 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SRA1Q9HD15 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRA1Q9HD15 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRA1Q9HD15 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRA1Q9HD15 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRA1Q9HD15 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SRA1Q9HD15 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRA1Q9HD15 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRA1Q9HD15 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRA1Q9HD15 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRA1Q9HD15 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRA1Q9HD15 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRA1Q9HD15 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRA1Q9HD15 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRA1Q9HD15 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRA1Q9HD15 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRA1Q9HD15 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRA1Q9HD15 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRA1Q9HD15 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRA1Q9HD15 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRA1Q9HD15 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRA1Q9HD15 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRA1Q9HD15 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRA1Q9HD15 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRA1Q9HD15 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRA1Q9HD15 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRA1Q9HD15 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRA1Q9HD15 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRA1Q9HD15 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRA1Q9HD15 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRA1Q9HD15 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRA1Q9HD15 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRA1Q9HD15 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SRA1Q9HD15 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRA1Q9HD15 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRA1Q9HD15 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRA1Q9HD15 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRA1Q9HD15 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRA1Q9HD15 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRA1Q9HD15 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SRA1Q9HD15 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRA1Q9HD15 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRA1Q9HD15 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRA1Q9HD15 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRA1Q9HD15 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRA1Q9HD15 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRA1Q9HD15 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRA1Q9HD15 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRA1Q9HD15 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRA1Q9HD15 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRA1Q9HD15 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRA1Q9HD15 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRA1Q9HD15 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRA1Q9HD15 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SRA1Q9HD15 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRA1Q9HD15 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRA1Q9HD15 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRA1Q9HD15 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRA1Q9HD15 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRA1Q9HD15 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRA1Q9HD15 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRA1Q9HD15 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRA1Q9HD15 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRA1Q9HD15 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRA1Q9HD15 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRA1Q9HD15 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRA1Q9HD15 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRA1Q9HD15 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRA1Q9HD15 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRA1Q9HD15 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRA1Q9HD15 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRA1Q9HD15 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRA1Q9HD15 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRA1Q9HD15 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRA1Q9HD15 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRA1Q9HD15 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SRA1Q9HD15 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SRA1Q9HD15 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SRA1Q9HD15 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRA1Q9HD15 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRA1Q9HD15 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRA1Q9HD15 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRA1Q9HD15 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRA1Q9HD15 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRA1Q9HD15 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SRA1Q9HD15 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SRA1Q9HD15 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms