Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Z2

LIN28A, Protein lin-28 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28AQ9H9Z2 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LIN28AQ9H9Z2 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LIN28AQ9H9Z2 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LIN28AQ9H9Z2 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LIN28AQ9H9Z2 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LIN28AQ9H9Z2 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LIN28AQ9H9Z2 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LIN28AQ9H9Z2 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LIN28AQ9H9Z2 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LIN28AQ9H9Z2 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LIN28AQ9H9Z2 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LIN28AQ9H9Z2 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LIN28AQ9H9Z2 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LIN28AQ9H9Z2 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LIN28AQ9H9Z2 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LIN28AQ9H9Z2 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LIN28AQ9H9Z2 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LIN28AQ9H9Z2 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LIN28AQ9H9Z2 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LIN28AQ9H9Z2 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LIN28AQ9H9Z2 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LIN28AQ9H9Z2 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LIN28AQ9H9Z2 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LIN28AQ9H9Z2 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LIN28AQ9H9Z2 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LIN28AQ9H9Z2 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LIN28AQ9H9Z2 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LIN28AQ9H9Z2 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LIN28AQ9H9Z2 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
LIN28AQ9H9Z2 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
LIN28AQ9H9Z2 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LIN28AQ9H9Z2 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LIN28AQ9H9Z2 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LIN28AQ9H9Z2 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LIN28AQ9H9Z2 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
LIN28AQ9H9Z2 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LIN28AQ9H9Z2 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LIN28AQ9H9Z2 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LIN28AQ9H9Z2 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LIN28AQ9H9Z2 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LIN28AQ9H9Z2 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LIN28AQ9H9Z2 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LIN28AQ9H9Z2 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LIN28AQ9H9Z2 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LIN28AQ9H9Z2 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LIN28AQ9H9Z2 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LIN28AQ9H9Z2 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LIN28AQ9H9Z2 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LIN28AQ9H9Z2 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LIN28AQ9H9Z2 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LIN28AQ9H9Z2 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LIN28AQ9H9Z2 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LIN28AQ9H9Z2 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LIN28AQ9H9Z2 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LIN28AQ9H9Z2 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LIN28AQ9H9Z2 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LIN28AQ9H9Z2 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LIN28AQ9H9Z2 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LIN28AQ9H9Z2 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LIN28AQ9H9Z2 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LIN28AQ9H9Z2 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LIN28AQ9H9Z2 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LIN28AQ9H9Z2 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LIN28AQ9H9Z2 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LIN28AQ9H9Z2 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LIN28AQ9H9Z2 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LIN28AQ9H9Z2 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LIN28AQ9H9Z2 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LIN28AQ9H9Z2 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LIN28AQ9H9Z2 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LIN28AQ9H9Z2 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LIN28AQ9H9Z2 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LIN28AQ9H9Z2 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
LIN28AQ9H9Z2 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LIN28AQ9H9Z2 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
LIN28AQ9H9Z2 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LIN28AQ9H9Z2 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LIN28AQ9H9Z2 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LIN28AQ9H9Z2 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LIN28AQ9H9Z2 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LIN28AQ9H9Z2 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LIN28AQ9H9Z2 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LIN28AQ9H9Z2 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
LIN28AQ9H9Z2 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LIN28AQ9H9Z2 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LIN28AQ9H9Z2 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LIN28AQ9H9Z2 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LIN28AQ9H9Z2 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LIN28AQ9H9Z2 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LIN28AQ9H9Z2 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LIN28AQ9H9Z2 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
LIN28AQ9H9Z2 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LIN28AQ9H9Z2 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LIN28AQ9H9Z2 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LIN28AQ9H9Z2 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LIN28AQ9H9Z2 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LIN28AQ9H9Z2 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LIN28AQ9H9Z2 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LIN28AQ9H9Z2 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LIN28AQ9H9Z2 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms