Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L4

SENP3, Sentrin-specific protease 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3Q9H4L4 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 USMG5-205ENST00000369825 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 TIMM23B-201ENST00000374098 1142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 CCDC58-205ENST00000479899 545 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 AC117522.2-201ENST00000510049 657 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 ALDH1L1-AS1-201ENST00000512384 437 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 SCARNA1-201ENST00000517138 166 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 AC087893.1-201ENST00000612818 664 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 AC092140.2-201ENST00000618027 521 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 TTC1-201ENST00000231238 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 TMX3-202ENST00000443099 913 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 AC008494.2-201ENST00000514544 370 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 OR8V1P-201ENST00000395193 873 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 ANKRD20A11P-205ENST00000442192 920 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 TCAIM-208ENST00000444602 1056 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 ANO3-205ENST00000531646 1264 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 ATF7IP2-206ENST00000543967 998 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 BNIP3P38-201ENST00000601117 544 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 AL591441.2-201ENST00000620059 535 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 AC004943.3-201ENST00000624116 600 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 ARPP21-202ENST00000396481 1304 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 AC087380.1-202ENST00000415970 1163 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 DPPA2P1-201ENST00000428060 556 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 Metazoa_SRP.26-201ENST00000547793 284 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms