Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0F6

SHARPIN, Sharpin, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHARPINQ9H0F6 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SHARPINQ9H0F6 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHARPINQ9H0F6 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHARPINQ9H0F6 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHARPINQ9H0F6 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHARPINQ9H0F6 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHARPINQ9H0F6 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHARPINQ9H0F6 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHARPINQ9H0F6 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHARPINQ9H0F6 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHARPINQ9H0F6 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SHARPINQ9H0F6 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SHARPINQ9H0F6 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SHARPINQ9H0F6 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SHARPINQ9H0F6 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SHARPINQ9H0F6 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SHARPINQ9H0F6 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SHARPINQ9H0F6 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SHARPINQ9H0F6 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SHARPINQ9H0F6 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SHARPINQ9H0F6 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SHARPINQ9H0F6 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SHARPINQ9H0F6 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SHARPINQ9H0F6 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SHARPINQ9H0F6 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SHARPINQ9H0F6 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SHARPINQ9H0F6 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SHARPINQ9H0F6 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SHARPINQ9H0F6 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SHARPINQ9H0F6 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SHARPINQ9H0F6 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SHARPINQ9H0F6 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SHARPINQ9H0F6 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SHARPINQ9H0F6 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SHARPINQ9H0F6 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SHARPINQ9H0F6 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SHARPINQ9H0F6 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SHARPINQ9H0F6 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SHARPINQ9H0F6 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SHARPINQ9H0F6 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SHARPINQ9H0F6 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SHARPINQ9H0F6 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SHARPINQ9H0F6 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SHARPINQ9H0F6 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SHARPINQ9H0F6 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SHARPINQ9H0F6 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SHARPINQ9H0F6 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SHARPINQ9H0F6 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SHARPINQ9H0F6 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SHARPINQ9H0F6 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SHARPINQ9H0F6 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SHARPINQ9H0F6 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SHARPINQ9H0F6 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SHARPINQ9H0F6 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SHARPINQ9H0F6 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SHARPINQ9H0F6 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.1 ms