Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDGFDQ9GZP0 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDGFDQ9GZP0 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDGFDQ9GZP0 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDGFDQ9GZP0 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDGFDQ9GZP0 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDGFDQ9GZP0 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDGFDQ9GZP0 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDGFDQ9GZP0 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDGFDQ9GZP0 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDGFDQ9GZP0 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDGFDQ9GZP0 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDGFDQ9GZP0 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDGFDQ9GZP0 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDGFDQ9GZP0 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDGFDQ9GZP0 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDGFDQ9GZP0 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDGFDQ9GZP0 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDGFDQ9GZP0 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDGFDQ9GZP0 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDGFDQ9GZP0 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDGFDQ9GZP0 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDGFDQ9GZP0 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PDGFDQ9GZP0 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDGFDQ9GZP0 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDGFDQ9GZP0 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDGFDQ9GZP0 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDGFDQ9GZP0 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDGFDQ9GZP0 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDGFDQ9GZP0 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDGFDQ9GZP0 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDGFDQ9GZP0 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDGFDQ9GZP0 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDGFDQ9GZP0 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDGFDQ9GZP0 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDGFDQ9GZP0 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDGFDQ9GZP0 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDGFDQ9GZP0 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDGFDQ9GZP0 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDGFDQ9GZP0 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDGFDQ9GZP0 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDGFDQ9GZP0 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDGFDQ9GZP0 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDGFDQ9GZP0 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDGFDQ9GZP0 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDGFDQ9GZP0 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDGFDQ9GZP0 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PDGFDQ9GZP0 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PDGFDQ9GZP0 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PDGFDQ9GZP0 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
PDGFDQ9GZP0 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PDGFDQ9GZP0 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PDGFDQ9GZP0 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PDGFDQ9GZP0 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PDGFDQ9GZP0 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PDGFDQ9GZP0 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PDGFDQ9GZP0 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PDGFDQ9GZP0 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDGFDQ9GZP0 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PDGFDQ9GZP0 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PDGFDQ9GZP0 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PDGFDQ9GZP0 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDGFDQ9GZP0 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDGFDQ9GZP0 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PDGFDQ9GZP0 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDGFDQ9GZP0 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDGFDQ9GZP0 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDGFDQ9GZP0 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDGFDQ9GZP0 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDGFDQ9GZP0 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDGFDQ9GZP0 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDGFDQ9GZP0 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDGFDQ9GZP0 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDGFDQ9GZP0 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDGFDQ9GZP0 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDGFDQ9GZP0 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDGFDQ9GZP0 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDGFDQ9GZP0 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDGFDQ9GZP0 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDGFDQ9GZP0 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDGFDQ9GZP0 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDGFDQ9GZP0 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PDGFDQ9GZP0 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDGFDQ9GZP0 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDGFDQ9GZP0 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDGFDQ9GZP0 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDGFDQ9GZP0 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PDGFDQ9GZP0 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDGFDQ9GZP0 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDGFDQ9GZP0 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDGFDQ9GZP0 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDGFDQ9GZP0 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDGFDQ9GZP0 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDGFDQ9GZP0 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDGFDQ9GZP0 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDGFDQ9GZP0 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDGFDQ9GZP0 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDGFDQ9GZP0 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDGFDQ9GZP0 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDGFDQ9GZP0 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms