Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms