Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SCAPERQ9BY12 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SCAPERQ9BY12 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SCAPERQ9BY12 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SCAPERQ9BY12 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SCAPERQ9BY12 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SCAPERQ9BY12 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SCAPERQ9BY12 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SCAPERQ9BY12 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SCAPERQ9BY12 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SCAPERQ9BY12 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SCAPERQ9BY12 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SCAPERQ9BY12 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SCAPERQ9BY12 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SCAPERQ9BY12 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
SCAPERQ9BY12 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SCAPERQ9BY12 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SCAPERQ9BY12 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SCAPERQ9BY12 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SCAPERQ9BY12 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SCAPERQ9BY12 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SCAPERQ9BY12 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SCAPERQ9BY12 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SCAPERQ9BY12 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SCAPERQ9BY12 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SCAPERQ9BY12 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SCAPERQ9BY12 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SCAPERQ9BY12 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SCAPERQ9BY12 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SCAPERQ9BY12 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SCAPERQ9BY12 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SCAPERQ9BY12 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SCAPERQ9BY12 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SCAPERQ9BY12 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SCAPERQ9BY12 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SCAPERQ9BY12 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SCAPERQ9BY12 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SCAPERQ9BY12 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SCAPERQ9BY12 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SCAPERQ9BY12 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SCAPERQ9BY12 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SCAPERQ9BY12 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SCAPERQ9BY12 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SCAPERQ9BY12 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SCAPERQ9BY12 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SCAPERQ9BY12 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SCAPERQ9BY12 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SCAPERQ9BY12 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SCAPERQ9BY12 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SCAPERQ9BY12 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SCAPERQ9BY12 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SCAPERQ9BY12 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SCAPERQ9BY12 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
SCAPERQ9BY12 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
SCAPERQ9BY12 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SCAPERQ9BY12 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
SCAPERQ9BY12 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SCAPERQ9BY12 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SCAPERQ9BY12 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SCAPERQ9BY12 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SCAPERQ9BY12 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SCAPERQ9BY12 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SCAPERQ9BY12 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SCAPERQ9BY12 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SCAPERQ9BY12 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SCAPERQ9BY12 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SCAPERQ9BY12 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SCAPERQ9BY12 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SCAPERQ9BY12 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SCAPERQ9BY12 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SCAPERQ9BY12 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SCAPERQ9BY12 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SCAPERQ9BY12 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SCAPERQ9BY12 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SCAPERQ9BY12 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SCAPERQ9BY12 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SCAPERQ9BY12 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SCAPERQ9BY12 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SCAPERQ9BY12 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SCAPERQ9BY12 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SCAPERQ9BY12 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SCAPERQ9BY12 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SCAPERQ9BY12 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SCAPERQ9BY12 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SCAPERQ9BY12 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SCAPERQ9BY12 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SCAPERQ9BY12 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SCAPERQ9BY12 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SCAPERQ9BY12 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SCAPERQ9BY12 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SCAPERQ9BY12 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SCAPERQ9BY12 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SCAPERQ9BY12 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SCAPERQ9BY12 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SCAPERQ9BY12 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SCAPERQ9BY12 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SCAPERQ9BY12 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SCAPERQ9BY12 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SCAPERQ9BY12 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SCAPERQ9BY12 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms