Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms