Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWE0

REPIN1, Replication initiator 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REPIN1Q9BWE0 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 YY1P1-201ENST00000427625 668 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 AC073569.1-201ENST00000548469 667 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms