Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms