Protein–RNA interactions for Protein: Q99653

CHP1, Calcineurin B homologous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHP1Q99653 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHP1Q99653 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHP1Q99653 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHP1Q99653 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHP1Q99653 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHP1Q99653 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHP1Q99653 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHP1Q99653 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHP1Q99653 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHP1Q99653 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHP1Q99653 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHP1Q99653 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHP1Q99653 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHP1Q99653 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHP1Q99653 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHP1Q99653 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHP1Q99653 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHP1Q99653 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHP1Q99653 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CHP1Q99653 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHP1Q99653 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHP1Q99653 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHP1Q99653 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHP1Q99653 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHP1Q99653 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHP1Q99653 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHP1Q99653 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHP1Q99653 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHP1Q99653 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHP1Q99653 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHP1Q99653 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHP1Q99653 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHP1Q99653 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHP1Q99653 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHP1Q99653 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHP1Q99653 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHP1Q99653 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHP1Q99653 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHP1Q99653 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHP1Q99653 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHP1Q99653 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHP1Q99653 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHP1Q99653 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHP1Q99653 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
CHP1Q99653 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHP1Q99653 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHP1Q99653 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHP1Q99653 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHP1Q99653 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHP1Q99653 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHP1Q99653 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHP1Q99653 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHP1Q99653 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CHP1Q99653 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHP1Q99653 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHP1Q99653 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHP1Q99653 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHP1Q99653 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CHP1Q99653 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CHP1Q99653 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CHP1Q99653 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHP1Q99653 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHP1Q99653 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHP1Q99653 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHP1Q99653 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHP1Q99653 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHP1Q99653 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHP1Q99653 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHP1Q99653 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHP1Q99653 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHP1Q99653 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHP1Q99653 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHP1Q99653 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHP1Q99653 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHP1Q99653 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHP1Q99653 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHP1Q99653 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHP1Q99653 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHP1Q99653 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHP1Q99653 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHP1Q99653 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHP1Q99653 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHP1Q99653 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHP1Q99653 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHP1Q99653 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CHP1Q99653 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CHP1Q99653 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHP1Q99653 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHP1Q99653 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHP1Q99653 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHP1Q99653 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHP1Q99653 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHP1Q99653 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHP1Q99653 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHP1Q99653 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHP1Q99653 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHP1Q99653 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHP1Q99653 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHP1Q99653 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHP1Q99653 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms