Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNGAP1Q96PV0 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNGAP1Q96PV0 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNGAP1Q96PV0 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNGAP1Q96PV0 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNGAP1Q96PV0 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNGAP1Q96PV0 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNGAP1Q96PV0 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNGAP1Q96PV0 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNGAP1Q96PV0 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNGAP1Q96PV0 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNGAP1Q96PV0 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNGAP1Q96PV0 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNGAP1Q96PV0 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYNGAP1Q96PV0 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYNGAP1Q96PV0 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYNGAP1Q96PV0 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYNGAP1Q96PV0 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYNGAP1Q96PV0 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SYNGAP1Q96PV0 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYNGAP1Q96PV0 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYNGAP1Q96PV0 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SYNGAP1Q96PV0 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYNGAP1Q96PV0 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SYNGAP1Q96PV0 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYNGAP1Q96PV0 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYNGAP1Q96PV0 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYNGAP1Q96PV0 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYNGAP1Q96PV0 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYNGAP1Q96PV0 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SYNGAP1Q96PV0 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYNGAP1Q96PV0 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYNGAP1Q96PV0 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYNGAP1Q96PV0 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SYNGAP1Q96PV0 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SYNGAP1Q96PV0 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SYNGAP1Q96PV0 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SYNGAP1Q96PV0 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SYNGAP1Q96PV0 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SYNGAP1Q96PV0 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SYNGAP1Q96PV0 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SYNGAP1Q96PV0 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SYNGAP1Q96PV0 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SYNGAP1Q96PV0 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SYNGAP1Q96PV0 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SYNGAP1Q96PV0 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SYNGAP1Q96PV0 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SYNGAP1Q96PV0 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SYNGAP1Q96PV0 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYNGAP1Q96PV0 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYNGAP1Q96PV0 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYNGAP1Q96PV0 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYNGAP1Q96PV0 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYNGAP1Q96PV0 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYNGAP1Q96PV0 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYNGAP1Q96PV0 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYNGAP1Q96PV0 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYNGAP1Q96PV0 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYNGAP1Q96PV0 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SYNGAP1Q96PV0 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SYNGAP1Q96PV0 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYNGAP1Q96PV0 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYNGAP1Q96PV0 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYNGAP1Q96PV0 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYNGAP1Q96PV0 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYNGAP1Q96PV0 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYNGAP1Q96PV0 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYNGAP1Q96PV0 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYNGAP1Q96PV0 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYNGAP1Q96PV0 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYNGAP1Q96PV0 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYNGAP1Q96PV0 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYNGAP1Q96PV0 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYNGAP1Q96PV0 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYNGAP1Q96PV0 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYNGAP1Q96PV0 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYNGAP1Q96PV0 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYNGAP1Q96PV0 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYNGAP1Q96PV0 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYNGAP1Q96PV0 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYNGAP1Q96PV0 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYNGAP1Q96PV0 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYNGAP1Q96PV0 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYNGAP1Q96PV0 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYNGAP1Q96PV0 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYNGAP1Q96PV0 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYNGAP1Q96PV0 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYNGAP1Q96PV0 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYNGAP1Q96PV0 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYNGAP1Q96PV0 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYNGAP1Q96PV0 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYNGAP1Q96PV0 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYNGAP1Q96PV0 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYNGAP1Q96PV0 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYNGAP1Q96PV0 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYNGAP1Q96PV0 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SYNGAP1Q96PV0 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYNGAP1Q96PV0 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYNGAP1Q96PV0 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYNGAP1Q96PV0 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms