Protein–RNA interactions for Protein: Q96PQ0

SORCS2, VPS10 domain-containing receptor SorCS2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS2Q96PQ0 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms