Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms