Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms