Protein–RNA interactions for Protein: Q96G28

CFAP36, Cilia- and flagella-associated protein 36, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP36Q96G28 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CFAP36Q96G28 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CFAP36Q96G28 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CFAP36Q96G28 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CFAP36Q96G28 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CFAP36Q96G28 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CFAP36Q96G28 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CFAP36Q96G28 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CFAP36Q96G28 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CFAP36Q96G28 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CFAP36Q96G28 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CFAP36Q96G28 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CFAP36Q96G28 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CFAP36Q96G28 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CFAP36Q96G28 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CFAP36Q96G28 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CFAP36Q96G28 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CFAP36Q96G28 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CFAP36Q96G28 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CFAP36Q96G28 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CFAP36Q96G28 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CFAP36Q96G28 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CFAP36Q96G28 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CFAP36Q96G28 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CFAP36Q96G28 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CFAP36Q96G28 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CFAP36Q96G28 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CFAP36Q96G28 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CFAP36Q96G28 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CFAP36Q96G28 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CFAP36Q96G28 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CFAP36Q96G28 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CFAP36Q96G28 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CFAP36Q96G28 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CFAP36Q96G28 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CFAP36Q96G28 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CFAP36Q96G28 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CFAP36Q96G28 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CFAP36Q96G28 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CFAP36Q96G28 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CFAP36Q96G28 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CFAP36Q96G28 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CFAP36Q96G28 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CFAP36Q96G28 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CFAP36Q96G28 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CFAP36Q96G28 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CFAP36Q96G28 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CFAP36Q96G28 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CFAP36Q96G28 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CFAP36Q96G28 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CFAP36Q96G28 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CFAP36Q96G28 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CFAP36Q96G28 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CFAP36Q96G28 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CFAP36Q96G28 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CFAP36Q96G28 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CFAP36Q96G28 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CFAP36Q96G28 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CFAP36Q96G28 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CFAP36Q96G28 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CFAP36Q96G28 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CFAP36Q96G28 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CFAP36Q96G28 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CFAP36Q96G28 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CFAP36Q96G28 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CFAP36Q96G28 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CFAP36Q96G28 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CFAP36Q96G28 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CFAP36Q96G28 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CFAP36Q96G28 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CFAP36Q96G28 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CFAP36Q96G28 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CFAP36Q96G28 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CFAP36Q96G28 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CFAP36Q96G28 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CFAP36Q96G28 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CFAP36Q96G28 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CFAP36Q96G28 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CFAP36Q96G28 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CFAP36Q96G28 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CFAP36Q96G28 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CFAP36Q96G28 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CFAP36Q96G28 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CFAP36Q96G28 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CFAP36Q96G28 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CFAP36Q96G28 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CFAP36Q96G28 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CFAP36Q96G28 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CFAP36Q96G28 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CFAP36Q96G28 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CFAP36Q96G28 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CFAP36Q96G28 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CFAP36Q96G28 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CFAP36Q96G28 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CFAP36Q96G28 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CFAP36Q96G28 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CFAP36Q96G28 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CFAP36Q96G28 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CFAP36Q96G28 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CFAP36Q96G28 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms